互換性はありますが、一部の命令で基本ステップが変更になります。
GX Works2でPCタイプ変更を実施すると容量オーバとなる可能性があるため、
PCタイプ変更を実施後、メモリ容量計算機能を用いてプログラムの容量を確認してください。

詳細は、下記テクニカルニュースの最新版を参照願います。
・No.FA-D-0147 ： QnUD(E)(H)CPUからQnUDVCPUへ置き換えた場合の留意点