GT Designer2で作成したGOT-A900シリーズのプロジェクトデータは
GT Designer3 (GOT2000)で使用できません。
以下の手順を行って、GOT2000シリーズのプロジェクトデータに変換してください。
◆GT Designer3 (GOT2000) Version1.100E以降の場合
　(1) GT Designer2で作成したGOT-A900シリーズのプロジェクトデータの格納場所を確認します。
　(2) GT Designer3 (GOT1000)で、(1)のプロジェクトデータを開き、GOT1000データに変換し、保存します。
　　　GT Designer3 (GOT2000)で、(1)プロジェクトデータを開いた場合はGT Designer3 (GOT1000)が
　　　起動されます。
　(3) (2)のプロジェクトデータを、 [共通の設定]→[GOT 機種設定]で、GOT タイプのシリーズで
　　　「GOT2000」を選択して「OK」をクリックします。
　(4) GOT2000シリーズ用のプロジェクトデータに変換され、「GT Designer3 (GOT2000)」が起動します。

詳細については下記テクニカルニュースを参照してください。
GOT-A900シリーズからGOT2000シリーズへの置き換え時の注意事項 (GOT-D-0062)