多段速選択が優先されますので、Mダイヤルでの設定は無視される仕様の為です。多段速選択がOFFのときにMダイヤルでの設定が有効になります。
Pr.79 ＝「3」の周波数指令の優先順位は、「多段速運転（RL/RM/RH/REX）＞PID制御（X14）＞端子４アナログ入力（AU）＞操作パネルによるデジタル入力」となります。