Windowsの表示倍率(拡大率)設定をご確認ください。
テキストや項目のサイズ、または表示倍率(拡大率)が大きく設定されている場合、文字が重なったり、メッセージやボタンの枠から文字がはみ出したりすることがあります。
テキストや項目のサイズ、および表示倍率(拡大率)の設定を見直してください。

処置方法の詳細については、下記マニュアルの「トラブルシューティング」を参照してください。
GX Works3 オペレーティングマニュアル(SH-081214)

※下欄[ドキュメント]-[マニュアル番号]のリンクから該当マニュアルを参照できます。