GT Designer3 (GOT2000)でCSVファイルを追加出力するように設定してください。
[ユーザアラーム監視]ダイアログで指定したトリガ種別のタイミングでCSVファイルが
生成されます。

◆GT Designer3 (GOT2000) Version1.100E以降の場合
GT Designer3 (GOT2000)で1.、2.を実施してください。
GOT実行時に3.を実施してください。
1. [アラーム共通設定]ダイアログで、
　 [アラームログを保存し，Unicodeテキスト/CSVに変換する(プロジェクト共通)]をチェックし、
　 [変換トリガデバイス]と[アラームID指定デバイス]を設定します。
2. [ユーザアラーム監視]ダイアログ-[ファイル保存]タブを選択し、[アラームログファイルを保存する]にチェックし、
　 [保存トリガ]の[トリガ種別]を指定、[ファイル変換]の[変換方式]は[CSV]を選択します。
3. [アラームID指定デバイス]に変換するアラームIDを入力し、[変換トリガデバイス]をONしてください。

詳細については、下記を参照してください。
GT Designer3 (GOT2000) 画面設計マニュアル (SH-081219-W)
「9.1.2章 デバイスを監視してアラームを収集する」